O processo seletivo da Prozoo, é exclusivo para alunos de Zootecnia da Universidade Federal do Paraná e é aberto no início de cada semestre, março e agosto. O PS é constituído por 5 etapas: Inscrição, entrevista, dinâmica em grupo, desafio e processo trainee.

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Os aprovados na entrevista e na dinâmica, passam para um período de Trainee. No qual, os candidatos irão conhecer o funcionamento da empresa e a história do MEJ. Ao final desse período, o candidato é avaliado e é decidido para qual diretoria ele irá seguir.